40年工龄退休金是按90%计算，国家规定公务员退休工资的比例为工龄35年以上的，按90%比例计发退休工资，且最高为90%的比例。

根据《关于机关事业单位工作人员养老保险制度改革的决定》第三条实行社会统筹与个人账户相结合的基本养老保险制度，工龄40年的事业单位退休人员其养老金计算为：基本养老金+过渡性养老金+个人账户养老金。

基础养老金计算公式：退休时当地上年度职工月平均工资*[1+(视同缴费指数×视同缴费年限+实际平均缴费指数×实际缴费年限)/缴费年限]/2*缴费年限*1%

过渡性养老金计算公式：退休时当地上年度职工月平均工资*实行个人账户前的缴费年限*1.3%*平均缴费指数

个人账户养老金计算公式：退休时本人账户余额/计发月数